而偃師商城是商族為主體創造的，這個也沒有任何爭議。根據北京大學AMS測年法得出的偃師商城早期宮殿和宮城始建年代結論，其建設時間不早于公元前1606年。
此外，中科院遺傳與發育生物學研究所劉皓芳博士的研究也顯示，二里頭遺址出土人骨與偃師商城古人群母系遺傳（mtDNA）關系較遠。
二里頭遺址和偃師商城相距只有6公里，在前一個王朝都城近在咫尺的地方，存在一個敵對勢力（或者叫非本族勢力）的城邑，合理的解釋就是改朝換代，所以，夏商周斷代工程將偃師商城宮城的建設時間作為了夏商分界時間。
二是二里頭遺址自身所呈現出的由盛到衰的景象。得益于碳十四測年技術的進步，二里頭文化按照陶器、禮器和大型建筑的變化，可以相對精準地劃分為四期，分別是：
一期（前1750年-前1680年）、二期（前1680年-前1610年）、三期（前1610年-前1560年）、四期（前1560年-前1520年）。
從巨觀視角來看，二里頭文化在一期時面積為100萬平方公尺，從二期開始規模逐漸擴大到了300萬平方公尺，但到了二里崗早商文化時期，二里頭遺址規模極速縮減到了30萬平方公尺。
二里頭文化從二期到三期階段是興盛期，這一時期，以二里頭遺址為中心的二里頭文化大規模向外輻射，二里頭所出土的典型器物在整個河南、晉南，甚至長江流域都有發現，但這些地區的典型器物卻極少在二里頭遺址出土，說明是二里頭單向對外傳播的結果，佐證了當時的二里頭的確是當時中原地區的政治、經濟、文化中心。
但到了二里頭文化三期、四期階段時，二里頭文化對周邊的文化輻射停止，反而是冀南豫北下七垣文化的典型器物鬲、山東岳石文化的典型器物紅陶篦紋深腹罐大量出現在二里頭遺址當中。說明此時的二里頭遺址已經喪失了對中原腹地的主導權，有大量商、夷文化因素涌入。
再從微觀視角來看，二里頭文化二期到三期階段，新建了東西并列、由多重院落組成的大型宮殿建筑、1000平方公尺的綠松石器作坊和大量貴族墓葬，奠定了中國最早的「井」字形王都布局，處處呈現的都是王朝都城景象。
而到了二里頭文化三期、四期階段時，大型宮室建筑D3、D5遭到廢棄，原本的宮城之內出現了大批普通居民文化遺存，這跟此前宮殿區的獨占性、排他性、神圣性形成了鮮明對比，說明此時的二里頭遺址已經從王都淪落為一般性城邑。
所以，公元前1600年左右，也就是二里頭文化三四期之時，無論是巨觀還是微觀層面，二里頭的地位都呈現出衰落的跡象，與夏商鼎革歷史事件吻合。
首先，二里頭遺址從一期到四期，考古始終沒有發現任何遭遇外部勢力暴力侵襲的痕跡，不僅沒有類似陶寺、殷墟那種王陵被盜掘的情形，也沒有發現人口大量非正常死亡、婦女受辱的場景。被廢棄的大型宮室建筑D3、D5，原因是D6建筑擴建而導致的自然更迭。
其次，二里頭遺址在偃師商城興建以后，城內人口進一步增加，服務于貴族的鑄銅作坊和綠松石龍形器作坊仍在大量生產，且生產的青銅器具越發精良。
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